Po podpisaniu aktu erekcyjnego Europejskiego Centrum Solidarności, jego założyciele ogłosili konkurs architektoniczny na nową siedzibę instytucji, która miała zostać wybudowana na terenie Stoczni Gdańskiej. Zwycięski projekt doskonale łączył potrzeby tej dużej i nowoczesnej instytucji z historyczną przestrzenią, która jest częścią Listy Światowego Dziedzictwa UNESCO. Budowa została współfinansowana przez Ministerstwo Kultury i Dziedzictwa Narodowego oraz Miasto Gdańsk. Duże wsparcie przyniosły także fundusze europejskie (Europejski Fundusz Rozwoju Regionalnego).

Nowy budynek Europejskiego Centrum Solidarności został ukończony w 2014 roku. Wszystkie kolekcje instytucji zostały przeniesione do jej nowej siedziby. Zyskano przestrzeń archiwalną, która wreszcie pozwoliła na zdeponowanie wszystkich muzealiów w jednym miejscu. Usprawniony został proces dygitalizacji i organizacji elementów kolekcji, która mogła się dzięki temu rozwijać. Ponadto, po raz pierwszy uzyskano własną przestrzeń wystawienniczą. W nowym budynku natychmiast rozpoczęto przygotowania do pierwszej stałej wystawy.